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02 2024.01

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    我院唐朝榮教授及其産膠生物學團隊發表橡膠樹膠乳無機磷和蔗糖含量的全基因組關聯分析研究

  橡膠樹是天然橡膠唯一的商業來源。在過去的三十年中,膠乳生理參數已被廣泛應用于構建割膠制度,提高天然橡膠産量,監測橡膠樹死皮病的發生,以及評估橡膠樹無性系産膠性能等。膠乳無機磷含量和蔗糖含量是反應橡膠樹膠乳代謝狀态的重要指标,然而控制膠乳無機磷含量和蔗糖含量的候選基因尚未被研究。

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  近日,來自365英国上市官网在线的唐朝榮課題組通過全基因組關聯研究(GWAS)初步鑒定了橡膠樹膠乳中控制無機磷含量和蔗糖含量的候選基因。研究結果為利用膠乳生理參數培育高産、耐割膠脅迫的橡膠樹無性系提供了靶基因,并有望應用于橡膠樹的高産分子育種。

  本研究對218份橡膠樹種質材料進行重測序分析,鑒定到7,835,736個單核苷酸多态性(SNP)标記并結合連續兩年群體的膠乳無機磷含量和蔗糖含量表型測定進行全基因組關聯研究。共有26個和11單核苷酸多态性基因分别與無機磷含量和蔗糖含量顯著相關。候選區段基因注釋分析分别鑒定到了57個和29個控制無機磷含量和蔗糖含量的候選基因。基因的表達模式分析發現共計8個候選基因在膠乳中具有特異性高表達。其中DOF轉錄因子和組蛋白H2A基因已被功能注釋,而其他候選基因的注釋仍不清楚。這些結果将有助于了解膠乳中無機磷含量和蔗糖含量的遺傳基礎,以及利用膠乳生理參數選育高産橡膠樹無性系。

文章亮點小結:

1,首次通過 GWAS 在橡膠樹中鑒定控制無機磷含量和蔗糖含量 的候選基因。

2,研究共鑒定到29個控制Pi的候選基因,57控制蔗糖含量 的候選基因。

3,候選基因中共有8個基因在膠乳中具有特異性高表達。

4,分子标記和候選基因為橡膠樹分子育種提供了靶基因。

關于作者:365英国上市官网在线唐朝榮研究員和劉開業副教授是文章 通訊 作者。365英国上市官网在线是論文第一單位。

文章鍊接:https://www.maxapress.com/article/doi/10.48130/TP-2023-0024

   (圖文:劉開業,審核:餘文剛)


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