熱帶生物組學大數據計算及應用團隊-陸俊锟

團隊名稱：熱帶生物組學大數據計算及應用團隊

所屬協同創新中心：生态文明協同創新中心

團隊負責人：

陸俊锟，博士，研究員，2011年在中國林科院獲森林培育專業博士學位。2017年國家自然科學基金優秀青年基金獲得者，2019年入選全國林草科技創新領軍人才，2022年入選中國林科院青年領軍人才支持計劃。

陸俊锟研究員長期從事樹木生理研究。在應用基礎研究方面，針對寄生植物檀香與寄主植物間的生理生态特性，發現檀香兼具自養與異養的混合養分攝取機制；揭示根系分泌物識别是檀香寄主偏好性的關鍵步驟，證實了海南黃花梨通過分泌黃酮、酚類物質來誘導檀香吸器趨向性生長，使兩樹種間建立更多的養分傳輸通道，從而促進檀香的生長與養分積累；發現檀香與海南黃花梨間存在着明顯的氮素雙向傳遞，并提出和證明了海南黃花梨接種高效固氮根瘤菌後，兩樹種間的氮素傳遞率顯著提高的創新觀點。上述研究得到國内外同行的高度評價，産生了較大的國際影響力。近10年來，陸俊锟團隊先後主持省部級課題10項，包括國家自然科學基金5項、青年科學家項目1項等。以第一或通訊作者發表SCI論文15篇。已授權專利2件。

團隊研究方向：

1. 檀香-黃花梨寄生理化性質和分子基礎的研究；

1. 開發基因組、轉錄組、蛋白組、表型組等大數據分析軟件和算法優化，以及數據庫構建；

2. 基于生物組學數據研究熱帶林木花卉優異性狀形成的遺傳基礎。

團隊成員：

1. 謝尚潛，教授；

2. 唐敏強，副教授

團隊代表性成果：

代表性論文：

(1) Mixture enhances microbial network complexity of soil carbon, nitrogen and phosphorus cycling in Eucalyptus plantations[J]. Forest Ecology and Management, 2024, 553: 121632. (陸俊锟唯一通訊作者);

(2) Nitrogen rather than carbon released by litter decomposition mediates nutrient relationships in a multispecies forest plantation with hemiparasite [J]. Science of the Total Environment, 2023, 888: 164176. (陸俊锟唯一通訊作者)；

(3) Host root exudates initiate a foraging preference by the root parasite Santalum album [J]. Tree Physiology, 2022, 43: 301-314. (陸俊锟唯一通訊作者，他引2次)；

(4) Melatonin enhances nitrogen metabolism and haustorium development in hemiparasite Santalum album Linn. Environmental and Experimental Botany, 2021, 186: 104460. (陸俊锟唯一通訊作者，他引8次);

(5) Impacts of nitrogen on physiological interactions of the hemiparasitic Santalum album and its N₂-fixing host Dalbergia odorifera. Trees-Structure and Function, 2021, 35: 1039–1051. (陸俊锟唯一通訊作者，他引5次);

(6) SCSit: A high-efficiency preprocessing tool for single-cell sequencing data from SPLiT-seq.Computational and Structural Biotechnology Journal, 2021.(謝尚潛通訊作者，他引3次);

(7) DNA N6-Methyladenosine modification role in transmitted variations from genomic DNA to RNA in Herrania umbratica. BMC genomics, 2019, 20:508.(謝尚潛通訊作者，他引4次);

(8) MDR: an integrative DNA N6-methyladenine and N4-methylcytosine modification database for Rosaceae. Horticulture Research, 2019, 6: 78.(謝尚潛通訊作者，他引58次);

(9) Genome-wide characterization of R2R3-MYB gene family in Santalum album and their expression analysis under cold stress. Frontiers in Plant Science, 2023,14:1142562.(唐敏強第一作者，謝尚潛通訊作者，他引3次);

(10) Arabidopsis GDSL1 overexpression enhances rapeseed Sclerotinia sclerotiorum resistance and the functional identification of its homolog in Brassica napus. Plant Biotechnology Journal, 2020,18,1255-1270;(唐敏強第一作者，他引33次).

代表性專利：

1、謝尚潛，肖傳樂，謝志.基于多組學豐度信息的蛋白質二級質譜鑒定方法,201610737420.7;

2、謝尚潛，劉宇枭，林加論，邢劍鋒.一種單細胞測序的數據分類方法,201811501781.7;

3. 唐敏強, 胡旭, 王志勇, 廖麗, 郝江珊, 許濤, 潘佳慧. 一種海雀稗耐镉性狀的SNP分子标記及其應用,2023, ZL202110974836.1;

代表性著作：

1. Gill Ali, Md Mostofa Uddin Helal, Minqiang Tang, Ming Hu, Chaobo Tong, Shengyi Liu: High-Throughput Association Mapping in Brassica napus L.: Methods and Applications. Springer，2022.

獲獎及榮譽稱号：

1）中國林學會第七屆梁希青年論文二等獎，2018;

2）全國林草科技創新人才計劃科技創新領軍人才，2019;

3）森林中的吸血鬼——廣寄生, 全國優秀林草科普微視頻, 2023。

團隊合影：