個人簡介

  美國加州大學戴維斯分校訪問學者，海南省南海青年名家，中國民族醫藥協會黎醫藥分會理事，熱區石漠化山地綠色高效農業科技新聯盟理事，365英国上市官网在线熱帶作物學院副院長，中國熱帶農業科學院熱帶生物組學大數據中心副主任。中央民族大學聯合培養研究生導師，中國農業大學聯合培養博士研究生導師，青海大學聯合培養博士研究生導師。近10年來一直從事基因組，重測序，轉錄組和高通量技術開發等研究，在生物信息學，分子育種技術方法領域廣泛涉獵和較豐富的研究經驗。建立了高通量多組學圖譜和高性能生物信息技術為基礎的技術平台。在熱帶生物組學大數據中心，執行開發了多維度組學創新平台，提供一個全新的在染色體層面上的基因組、甲基化、轉錄組的大數據分析體系。不斷開發新的實驗技術和大數據算法。原創研發兩代超低成本基因型分型技術和表觀遺傳分析技術，現已成功用于約20個物種研究中，已申報國家發明專利四項，榮獲國家發明專利授權一項。在Nucleic  Acids Research、Biotechnol Biofuels、Molecular Ecology  Resources、Nature、Nature  Communications等SCI雜志發表具有影響力的學術論文，累積影響因子約200，其中第一作者或通訊作者22篇，累積影響因子約100。擔任2項國家重點研發項目專題負責人，主持和參加國家自然科學基金、重點基金、科技部973項目、國家木薯産業體系等科研項目10餘項。

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一、基本信息

姓名: 夏志強  

性别: 男

民族: 漢

出生年月: 1982年10月

學位: 博士

職稱: 研究員

開設課程：基因組學（研究生），生物信息學（研究生），南繁育種（本科）

主要研究方向：基因組與大數據育種

博士研究生招生方向：作物遺傳育種

碩士研究生招生方向：作物學\農藝與種業\資源利用與植物保護

二、聯系方式

E-mail: zqiangx@gmail.com

三、教育經曆

2016.01-2017.11 美國 加州大學戴維斯分校UCDavis 訪問學者/生物信息學

2012.09-2018.12 中國 華中農業大學 作物遺傳育種 博士

2005.09-2008.06 中國 365英国上市官网在线 作物遺傳育種 碩士

2001.09-2005.06 中國 華南熱帶農業大學 生物技術 學士

四、科研與學術工作經曆

2020.07-至今   中國 365英国上市官网在线 副研究員

2018.01-2020.07 中國 中國熱帶農業科學院熱帶生物技術研究所 副研究員

2013.01-2017.12  中國 中國熱帶農業科學院熱帶生物技術研究所 助理研究員

2008.12-2012.12  中國 中國熱帶農業科學院熱帶生物技術研究所 研究實習員

五、代表性科研項目

1. 國家重點研發計劃項目，2019YFD1000500，熱帶作物種質資源精準評價與基因發掘，2019.01-2022.12，120萬，在研，專題負責人

2. 國家重點研發計劃項目，2019YFD1001100，熱帶作物高效育種技術與品種創制，2019.01-2022.12，200萬，在研，專題負責人

3. 滇桂黔石漠化地區特色作物産業發展關鍵技術集成示範項目，SMH2019-2021，石漠化地區特色作物指紋圖譜開發，2019.01-2022.12，60萬，在研，主持

4. 國家自然科學基金青年基金項目，31301102，基因組随機擴增序列SNP多态性及甲基化多态性（AFSM），2014.01-2016.12，23萬元，已結題，主持

六、編審

2017年7月-至今 Acta Physiologiae Plantarum國際學術期刊（SCI）

2018年12月-至今 Plos One國際學術期刊（SCI）

2018年2月-至今 Plant Physiology and Biochemistry 國際學術期刊（SCI）

2018年1月-至今 Frontiers of Agricultural Science and Engineering國際學術期刊（SCI）

2019年6月-至今 Industrial Crops and Products國際學術期刊（SCI 一區）

2019年12月-至今 Biotechnol Biofuels 國際學術期刊（SCI 一區）

2020年1月-至今 Horticulture Research國際學術期刊（SCI一區）

七、代表性成果

      （一）授權專利

       1) 測序引物組及基于PCR的全基因組測序方法 201910261027.9

       2) 基因組随機擴增序列SNP多态性及甲基化多态性（AFSM）201410154134.9

       3) 一種胞嘧啶甲基化挖掘的方法 201611198974.0

       4) 一種全基因組高效基因區富集測序方法201611199575.6

       5) Whole Genome High-Efficiency Gene Region Enriching and Sequencing Method 2021105278 2021.8 1 國際專利

       6) A Simple, Cost-effective and Amplification-based Whole Genome Sequencing  Approach 2020/06979 2021.6 1 國際專利

      （二）獲得獎勵

       1) 2015年海南省科技進步一等獎：木薯比較基因組及光合産物高效積累機理 2015-J-1-R-048

2) 2016-2017年度神農中華農業科技獎二等獎：木薯全基因組測序及育種基礎 KJ2017-R2-012-03

3) 2016年世界塊根塊莖作物大會（World Congress On Root And Tuber Crops）大會Poster一等獎

（三）學術論文

1)  Zhiqiang Xia, Dongmei Huang, Shengkui Zhang, Wenquan Wang, Funing Ma,  Bin Wu, Yi Xu, Bingqiang Xu, Di Chen, Meiling Zou, Huanyu Xu, Xincheng  Zhou, Rulin Zhan, Shun Song. Chromosome-Scale Genome Assembly Provides  Insights into the Evolution and Flavor Synthesis of Passion Fruit  (Passiflora edulis Sims) 2020（Horticulture Research, IF：6.793，一區，第一作者）

2)  Shengkui Zhang(#), Zhiqiang Xia(#), Wenqing Zhang, Can Li, Xiaohan  Wang, Xianqin Lu, Xianyan Zhao, Haizhen Ma, Xincheng Zhou, Weixiong  Zhang, Tingting Zhu, Pandao Liu, Guodao Liu, Hubiao Yang, Jacobo Arango,  Michael Peters, Wenquan Wang, Tao Xia Chromosome-Scale Genome Assembly  Provides Insights into Speciation of Allotetraploid and Massive Biomass  Accumulation of Elephant Grass (Pennisetum purpureum Schum.) Molecular  Ecology Resources 2022,1（（SCI收錄，IF：7.090，第一作者）

3)  Kaixing Fang, Zhiqiang Xia, Hongjian Li, Xiaohui Jiang, Dandan Qin,  Qiushuang Wang, Qing Wang, Chendong Pan, Bo Li and Hualing Wu,  Genome-wide Association Analysis Identifies Molecular Markers Asociated  with Tea Flavor-related Metabolites 2021（Horticulture Research,  IF：6.793，一區，第一作者）

4)  Xia Z, Zou M, Zhang S, Feng B, Wang W. AFSM sequencing approach: a  simple and rapid method for genome-wide SNP and methylation site  discovery and genetic mapping. Scientific Reports, 2014, 4: 7300.  （SCI收錄，IF：5.578，第一作者）

5)  Gu J#, Xia Z#, Luo Y, Jiang X, Qian B, Xie H, Zhu J, Xiong L, Zhu J,  Wang Z. Spliceosomal protein U1A is involved in alternative splicing and  salt stress tolerance in Arabidopsis thaliana. Nucleic Acids Res, 2018,  46(4):1777-1792.（SCI收錄，IF：11.561，第一作者）

6)  Xia Z, Zhang S, Wen M, Lu C, Sun Y, Zou M, Wang W. Construction of an  ultrahigh-density genetic linkage map for Jatropha curcas L. and  identification of QTL for fruit yield. Biotechnol Biofuels, 2018,  11:3（SCI收錄，IF：5.497，第一作者）

7)  Xia Z, Liu K, Zhang S, Yu W, Zou M, He L, Wang W. An ultra-high density  map allowed for mapping QTL and candidate genes controlling dry latex  yield in rubber tree. Industrial Crops and Products, 2018, 120:351-356.  （SCI收錄，IF：3.849，第一作者）

8)  Wang W#, Feng B#, Xiao J#, Xia Z, Zhao X, Li P, Zhang W, Wang Y, Moller  B, Liu B, Li K, Peng M. Cassava genome from a wild ancestor to  cultivated varieties. Nature Communications 2014,  5:5110（SCI收錄，IF：11.470，第二作者）

9)  Hu W#, Xia Z#, Yan Y, Ding Z, Tie W, Wang L, Zou M, Wei Y, Lu C, Hou X,  Wang W, Peng M. Genome-wide gene phylogeny of CIPK family in cassava  and expression analysis of partial drought-induced genes. Frontiers in  plant science 2015, 6: 914.（SCI收錄，IF：4.495，第一作者）

10)  Wei Y#, Shi H#, Xia Z#, Tie W, Ding Z, Yan Y, Wang W, Hu W, Li K.  Genome-Wide Identification and Expression Analysis of the WRKY Gene  Family in Cassava. Frontiers in plant science 2016, 7,  25:1-18（SCI收錄，IF：4.291，第一作者）

11)  Zou M, Lu C, Zhang S, Chen Q, Sun X, Ma P, Xia Z*, Wang W*. Epigenetic  map and genetic map basis of complex traits in cassava population.  Scientific Reports. 2017, 7: 41232. （SCI收錄，IF：4.259，通訊作者）

12)  Shengkui Zhang(#), Zhiqiang Xia(#), Wenqing Zhang, Can Li, Xiaohan  Wang, Xianqin Lu, Xianyan Zhao, Haizhen Ma, Xincheng Zhou, Weixiong  Zhang, Tingting Zhu, Pandao Liu, Guodao Liu, Hubiao Yang, Jacobo Arango,  Michael Peters, Wenquan Wang, Tao Xia Chromosome-Scale Genome Assembly  Provides Insights into Speciation of Allotetraploid and Massive Biomass  Accumulation of Elephant Grass (Pennisetum purpureum Schum.)  bioRxiv,2020 doi: https://doi.org/10.1101/2020.02.28.970749 （第一作者）

13)  Congshan Xu 1,†, Zhiqiang Xia 2,†, Zhiqiang Huang 3, Chao Xia 4, Jing  Huang 1, Manrong Zha 5, Shujuan Wang 1, Muhammad Imran 1,6, Shaun  Casteel 1,  Yiwei Jiang 1, Cankui Zhang 1,7,*Understanding the  Physiological and Transcriptional Mechanism of Reproductive Stage  Soybean in Response to Heat Stress 2020 Crop Breed Genet Genom  2020;2(1):e200004.

14)  Luo M, Gu Y, Puiu D, Wang H, Twardziok S, Deal K, Huo N, Zhu T, Wang L,  Wang Y, McGuire P, Liu S, Long H, Ramasamy R, Rodriguez J, Van S, Yuan  L, Wang Z, Xia Z, Xia L, Anderson O, Ouyang S, Liang Y, Zimin A, Pertea  G, Salzberg S, Devos K, Dvorak J. Genome sequence of the progenitor of  the wheat D genome Aegilops tauschii. Nature, 2017, 551:7681.  （SCI收錄，IF：41.577）

15)  Liu J#, Xia Z#, Tian X#, Li Y. Transcriptome sequencing and analysis of  rubber tree (Hevea brasiliensis Muell.) to discover putative genes  associated with tapping panel dryness (TPD). BMC Genomics 2015,16:398.  （SCI收錄，IF：3.867，第一作者）

16)  Hao C#, Xia Z#, Fan R, Tan L, Hu L, Wu B, Wu H. De novo transcriptome  sequencing of black pepper (Piper nigrum L.) and an analysis of genes  involved in phenylpropanoid metabolism in response to Phytophthora  capsici. BMC Genomics 2016, 17: 822. （SCI收錄，IF：3.729, 第一作者）

17)  Zhang S, Chen X, Lu C, Ye J, Zou M, Lu K, Feng S, Pei J, Liu C, Zhou X,  Ma P, Li Z, Liu C, Liao Q, Xia Z*, Wang W*. Genome-Wide Association  Studies of 11 Agronomic Traits in Cassava (Manihot esculenta Crantz).  Frontiers in Plant Science, 2018, 9:503. （SCI收錄，IF：3.678，通訊作者）

18)  Hu W#, Wei Y#, Xia Z#, Yan Y, Hou X, Zou M, Lu C, Wang W, Peng M.  Genome-wide identification and expression analysis of the NAC  transcription factor family in cassava. PloS one 2015, 10(8):  e0136993.（SCI收錄，IF：3.057，第一作者）

19)  Hu W#, Hou X#, Xia Z#, Yan Y, Wei Y, Wang L, Zou M, Lu C, Wang W, Peng  M. Genome-wide survey and expression analysis of the calcium-dependent  protein kinase gene family in cassava. Molecular Genetics and Genomics  2016, 291(1):241-253.（SCI收錄，IF：2.979，第一作者）

20)  Zou M#, Xia Z#, Ling P, Zhang Y, Chen X, Wei Z, Bo W, Wang W. Mining  EST-Derived SSR Markers to Assess Genetic Diversity in Cassava (Manihot  esculenta Crantz). Plant Mol Biol Rep, 2011, 29:961-971 (SCI，IF：2.153,  第一作者)

21)  Tang Y#, Xia Z#, Ding Z#, Ding Y, Liu Z, Ma X, Liu J. Construction of a  high-density linkage map and QTL mapping for important agronomic traits  in Stylosanthes guianensis (Aubl.) Sw. Scientific Reports, 2019,  9:3834.（影響因子：4.36，第一作者）

22)  Zou M#, Xia Z#, Lu C, Wang H, Ji J, Wang W. Genetic Diversity and  Differentiation of Aquilaria sinensis (Lour.) Gilg Revealed by ISSR and  SRAP Markers. CROP SCIENCE, 2012, 52(5):2304-2313 (SCI，IF：1.513, 第一作者)

23)  Chen X#, Xia Z#, Fu Y, Lu C, Wang W. Constructing a genetic linkage map  using an F-1 population of non-inbred parents in Cassava (Manihot  esculenta Crantz). Plant Mol Biol Reporter 2010, 28:676-683  (SCI，IF：0.825, 第一作者)

24)  Yang C#, Xia Z#, Hu J, Zhuang Y, Pan Y, Liu J. Transcriptome analysis  of Oncidium petals provides new insights into the initiation of petal  senescence. Journal of Horticultural Science and Biotechnology, 2018,  94(1):1-12.（影響因子：0.715，第一作者）

25)  Chen X, Xia J, Xia Z, Zhang H, Zeng C, Lu C, Zhang W, Wang W. Potential  functions of microRNAs in starch metabolism and development revealed by  miRNA transcriptome profiling of cassava cultivars and their wild  progenitor. BMC Plant Biology 2015, 15:33（SCI，IF：3.930）

26)  Ye J, Yang H, Shi H, Wei Y, Tie W, Ding Z, Yan Y, Luo Y, Xia Z, Wang W,  Peng M, Li K, Zhang H, Hu W. The MAPKKK gene family in cassava:  Genome-wide identification and expression analysis against drought  stress. Scientific reports 2017, 7: 14939.（影響因子：4.259）

27)  Ma P#, Chen X#, Liu C, Xia Z, Song Y, Zeng C, Li Y, Wang W. MePHD1 as a  PHD-Finger protein negatively regulates ADP-Glucose pyrophosphorylase  small subunit1a gene in cassava. International Journal of Molecular  Sciences 2018, 19: 2831.

28)  Shang S#, Wu C#, Huang C#, Tie W, Yan Y, Ding Z, Xia Z, Wang W, Peng M,  Tian L, Hu W. Genome-Wide Analysis of the GRF Family Reveals Their  Involvement in Abiotic Stress Response in Cassava. Genes 2018, 9:  110.（影響因子：3.49）

29)  Hu W, Yan Y, Tie W, Ding Z, Wu C, Ding X, Wang W, Xia Z, Guo J, Peng M.  Genome-Wide Analyses of Calcium Sensors Reveal Their Involvement in  Drought Stress Response and Storage Roots Deterioration after Harvest in  Cassava. Genes, 2018, 9: 221.（影響因子：3.49）

30)  Ou W#, Mao X#, Huang C#, Tie W, Yan Y, Ding Z, Wu C, Xia Z, Wang W,  Zhou S, Li K, Hu W. Genome-Wide Identification and Expression Analysis  of the KUP Family under Abiotic Stress in Cassava (Manihot esculenta  Crantz). Frontiers in Physiology. 2018; 9: 17.（影響因子：3.66）

31)  Hu M, Hu W, Xia Z, Zhou X, Wang W. Validation of Reference Genes for  Relative Quantitative Gene Expression Studies in Cassava (Manihot  esculenta Crantz) by Using Quantitative Real-Time PCR. Frontiers in  plant science 2016, 7:680（SCI，IF：3.678）

32)  Ma P#, Chen X#, Liu C, Meng Y, Xia Z, Zeng C, Lu C, Wang W. MeSAUR1,  encoded by a small auxin-up RNA gene, acts as a transcription regulator  to positively regulate ADP-glucose pyrophosphorylase small subunit1a  gene in cassava. Frontiers in Plant Science 2017, 8:1315.

33)  Xu C#, Xia C#, Xia Z, Zhou X, Huang J, Huang Z, Liu Y, Jiang Y, Casteel  S, Zhang C. Physiological and transcriptomic responses of reproductive  stage soybean to drought stress. Plant Cell Reports 2018, 37:1611-1624.

34)  Pei J, Wang H, Xia Z, Liu C, Chen X, Ma P, Lu C, Wang W. Phylogeny and  expression pattern of starch branching enzyme family genes in cassava  (Manihot esculenta Crantz) under diverse environments.  Molecular and  Cellular Biochemistry 2015, 406 (1): 273-284（SCI，IF：2.561）