最高學位

博士

畢業院校

北京師範大學

職　　稱

高聘副教授

職　　務

教師

所屬單位

365英国上市官网在线植物保護系

從事專業

生物信息學，植物病理學

導師類别

博士生、碩士生導師

辦公電話

E-mail

linrm2010@163.com, linrunmao@hainanu.edu.cn

個人簡曆

林潤茂，高聘副教授。2007獲北京交通大學理學學士學位，2015年獲中國農業科學院研究生院農學碩士學位，2018年獲北京師範大學理學博士學位。曾在華大基因、四川農業大學水稻研究所生物技術課題組和中國農業科學院蔬菜花卉研究所工作。主要緻力于基因組學和計算生物學、病原與寄主互作和生物防治研究，曾以第一作者或共同第一作者在Nature Communications，PLOS Pathogens，Applied Microbiology and Biotechnology等期刊發表學術論文。

研究方向

為了探索微生物如何适應植物寄主，并激活寄主免疫反應，以及微生物與寄主的協同演化，開展以下研究：（1）微生物基因組；（2）單細胞轉錄組；（3）微生物與寄主互作；（4）生物防治。

研究課題

6. 國家自然科學基金委員會，地區科學基金項目，立枯絲核菌效應蛋白Rspi2抑制水稻防禦反應的分子機制，32360641，2024-01至2027-12，在研，主持。

5. 海南省自然科學基金面上項目，基于單細胞轉錄組分析研究哈茨木黴T069與番茄根部的互作機制，823MS034，2023-03至2026-02，在研，主持。

4. 365英国上市官网在线科研啟動基金項目，木黴生防菌促進番茄根系生長的分子機制，KYQD(ZR)23023，2022-06至2027-06，在研，主持。

3. 國家自然科學基金委員會，國際（地區）合作與交流項目，植物三萜代謝多樣性的催化機制及功能研究，31920103003，2020-01至2024-12，在研，參加。

2. 中央級公益性科研院所基本科研業務費專項，葉片單細胞圖譜及其多樣性的解析，IVF-BRF2019020，已結題，主持。

1. 十三五國家重點研發計劃子課題，高效安全靶基因篩選及RNAi作用機制，2017YFD0200904，已結題，參加。

研究成果

學術論文（†，共同第一作者；*，通訊作者）：

16. Zhang D†, Lin R†, Yamamoto N†, Wang Z, Lin H, Okada K, Liu Y, Xiang X, Zheng T, Zheng H, Yi X, Noutoshi Y, Zheng A*. Mitochondrial-targeting effector RsIA_CtaG/Cox11 in Rhizoctonia solani AG-1 IA has two functions: plant immunity suppression and cell death induction mediated by a rice cytochrome c oxidase subunit. Molecular Plant Pathology. 2023. Online. doi: 10.1111/mpp.13397.

15. Zhang C†, Lin R†, Hou J, Khan R, Li X, Wei H, Chen J, Wang R, Zhang J, Liu T*. The unique sugar conversion and complex CAZyme system of Trichoderma brev T069 during solid-state fermentation of cassava peel. Industrial Crops and Products. 2023. Online. doi:10.1016/j.indcrop.2023.116263.

14. Zhang M†, Cheng X†, Lin R†, Xie B, Nauen R, Rondon SI, Zavala JA, Palli SR, Li S, Xiong X, Zhou W*, Gao Y*. Chromosomal-level genome assembly of potato tuberworm, Phthorimaea operculella: a pest of solanaceous crops. Scientific Data. 2022,9(1):748.

13. Zhang X†, Lin R†, Ling J, Wang Y, Qin F, Lu J, Sun X, Zou M, Qi J, Xie B*, Cheng X*. Roles of species-specific legumains in pathogenicity of the pinewood nematode Bursaphelenchus xylophilus. International Journal of Molecular Sciences. 2022,23(18):10437.

12. Wu J†, Liang J†, Lin R†, Cai X, Zhang L, Guo X, Wang T, Chen H, Wang X*. Investigation of Brassica and its relative genomes in the post-genomics era. Horticulture Research. 2022,9:uhac182.

11. Tian X†, Sun T†, Lin R†, Liu R, Yang Y, Xie B*, Mao Z*. Genome sequence resource of Sarocladium terricola TR, an endophytic fungus as a potential biocontrol agent against Meloidogyne incognita. Molecular Plant-Microbe Interactions. 2022,35(6):505-508.

10. Guo X†, Liang J†, Lin R†, Zhang L, Wu J, Wang X*. Series-spatial transcriptome profiling of leafy head reveals the key transition leaves for head formation in Chinese cabbage. Frontiers in Plant Science. 2022,12:787826.

9. Lin R†, Xia Y†, Liu Y†, Zhang D†, Xiang X, Niu X, Jiang L, Wang X, Zheng A*. Comparative mitogenomic analysis and the evolution of Rhizoctonia solani anastomosis groups. Frontiers in Microbiology. 2021,12:707281.

8. Yamamoto N†, Wang Y†, Lin R†, Liang Y, Liu Y, Zhu J, Wang L, Wang S, Liu H, Deng Q, Li S, Li P, Zheng A*. Integrative transcriptome analysis discloses the molecular basis of a heterogeneous fungal phytopathogen complex, Rhizoctonia solani AG-1 subgroups. Scientific Reports. 2019,9(1):19626.

7. Lin R†, Zhang X†, Xin B, Zou M, Gao Y, Qin F, Hu Q, Xie B*, Cheng X*. Genome sequence of Isaria javanica and comparative genome analysis insights into family S53 peptidase evolution in fungal entomopathogens. Applied Microbiology and Biotechnology. 2019,103(17):7111-7128.

6. Lin R†, Qin F†, Shen B†, Shi Q, Liu C, Zhang X, Jiao Y, Lu J, Gao Y, Suarez-Fernandez M, Lopez-Moya F, Lopez-Llorca LV, Wang G, Mao Z, Ling J, Yang Y, Cheng X*, Xie B*. Genome and secretome analysis of Pochonia chlamydosporia provide new insight into egg-parasitic mechanisms. Scientific Reports. 2018,8(1):1123.

5. Lin R†, He L†, He J, Qin P, Wang Y, Deng Q, Yang X, Li S, Wang S, Wang W, Liu H, Li P*, Zheng A*. Comprehensive analysis of microRNA-Seq and target mRNAs of rice sheath blight pathogen provides new insights into pathogenic regulatory mechanisms. DNA Research. 2016,23(5):415-425.

4. Wang G†, Liu Z†, Lin R†, Li E, Mao Z, Ling J, Yang Y, Yin WB*, Xie B*. Biosynthesis of antibiotic leucinostatins in bio-control fungus Purpureocillium lilacinum and their inhibition on Phytophthora revealed by genome mining. PLOS Pathogens. 2016,12(7):e1005685.

3. Lin R†, Liu C†, Shen B, Bai M, Ling J, Chen G, Mao Z, Cheng X*, Xie B*. Analysis of the complete mitochondrial genome of Pochonia chlamydosporia suggests a close relationship to the invertebrate-pathogenic fungi in Hypocreales. BMC Microbiology. 2015,15:5.

2. Lei D†, Lin R†, Yin C†, Li P*, Zheng A*. Global protein-protein interaction network of rice sheath blight pathogen. Journal of Proteome Research. 2014,13(7):3277-3293.

1. Zheng A†*, Lin R†, Zhang D, Qin P, Xu L, Ai P, Ding L, Wang Y, Chen Y, Liu Y, Sun Z, Feng H, Liang X, Fu R, Tang C, Li Q, Zhang J, Xie Z, Deng Q, Li S, Wang S, Zhu J, Wang L, Liu H, Li P*. The evolution and pathogenic mechanisms of the rice sheath blight pathogen. Nature Communications. 2013,4:1424.

專著：

1. Lin R, Cheng X*, Xie B*. Comparative analysis of Pochonia chlamydosporia mitogenome reveals dynamic mitochondrial evolution of the nematophagous fungi in Hypocreales. In: Perspectives in sustainable nematode management through Pochonia chlamydosporia applications for root and rhizosphere health. (eds Manzanilla-López RH, Lopez-Llorca LV). Springer. 2017,pp:183–195, Chapter 9.

授權專利：

1. 王曉武; 林潤茂; 武劍; 梁建麗; 郭新磊. 基于單細胞轉錄組測序數據的細胞聚類方法, 2022-02-08, 中國, ZL 2021 1 0983443.7.

軟件著作權：

2. 林潤茂; 劉銅; 王曉婷; 楊繁興; 王芷茵. 真菌線粒體基因組分析軟件, 2023-07-16，2023SR1163714.

1. 林潤茂; 王曉武; 武劍; 梁建麗; 郭新磊. CADEG：全基因組差異表達基因的比較分析軟件, 2020-03-19, 2020SR0277868.

獲得榮譽

海南自由貿易港E類人才

教學和研究生培養

社會兼職

招生專業

植物病理學、微生物學、生物信息學、數學、計算機科學、物理學等相關專業